خلافت اسلامی در سالهای ابتدایی تشکیل اش ، با تاکید بر اینکه برخی از مجازات ها ، حد الهی هستند و امکان توقف آنها نیست ، مجازات های خشنی همچون سنگسار ، اعدام ، شلاق و قطع دست را با تاکید بیشتری اجرا کرد. هرچند مجازات بریدن عضو ، در سالهای اخیر ، کمتر گزارش شده ، اما مجازات هایی دیگر ، همچنان اجرا می شود
محمد سیف زاده ، حقوقدان در تهران درمورد سابقه اجرای اینگونه مجازات ها به بخش فارسی صدای آمریکا می گوید :« اکثر فقه های اسلامی اجرای مقررات و مجازات های اسلامی را در زمان امام غیر معصوم قابل اجرا نمی دانستند زمان خمینی که او در کتاب تحریر الوسیله نوشت ، این مجازات ها را قابل اجرا می دانست و چند موردی هم از ابتدای انقلاب اجرا شده است
به گفته این وکیل دادگستری ، با توجه به احکام برخی علمای مدرن(!!) ، برای همخوانی مجازات های اینچنین با قانون جزای مدرن ، می توان این مجازات های خشن را به حالت تعلیق در آورد
این اظهار نظر در حالی ابراز می شود که رییس پلیس آگاهی (خلافت اسلامی) ایران در بخش دیگری از گفتگو با خبرگزاری کار ایران ، همچنین گفته اگر قطع دست بخصوص در مورد سارقان صورت بگیرد ، نود درصد سرقت ها ، انجام نمیشود!!!!؟
برخلاف ادعای این مقام پلیس! ، محمد سیف زاده معتقد است:" اجرای این مجازات های خشن تاثیر چندانی در کاهش جرم ندارد. چرا که سابقه نشان می دهد حبس ، اعدام ، شکنجه و قطع دست از جمله قدیمی ترین مجازات های جهان است که از جمله در کشور ما به کاهش جرم منجر نشده است"
اجرای مجازات های خشن در ایران همواره مورد اعتراض نهادهای بین المللی مدافع حقوق بشر بوده با این حال جعفری رییس پلیس آگاهی به خبرگزاری کار ایران گفته است: « نباید عقب نشینی کنیم و بهتر است که ما وظیفه مان در مقابل شرع را انجام دهیم